L’action se déroule en 1191, alors que la Troisième Croisade déchire la Terre Sainte. Vous incarnez Altaïr, un Maître Assassin, guerrier mystérieux et respecté, dont le seul nom suscite l’effroi et vous avez l’intention de mettre fin aux hostilités en vous attaquant aux leaders des deux camps qui s’affrontent. En incarnant Altaïr, le joueur agira selon l’art des Maîtres Assassins et ses actions sèmeront le chaos autour de lui.