Dans le jeu, vous incarnez Noé (celui de la Bible) devant, à l'aide d'un lance-pierre, faire rentrer des animaux dans votre arche. Le jeu s'écarte néanmoins de l'histoire originale, puisque vous aurez à lancer de la nourriture pour endormir les animaux et ensuite les collecter pour votre arche. Sauf que dans le jeu, au lieu d'avoir une paire de chaque animaux, vous aurez à vaincre des troupeaux entiers de chèvres et de moutons. Pour l'anecdote, le jeu est sorti sur Super Nintendo un peu avant la version PC. Mais le jeu ressemblait plus à un Game Genie qu'à un jeu traditionnel (le Game Genie s’insère au-dessous d’une cartouche et est introduit dans l’ouverture de la console). En fait, Wisdom Tree, Inc., l'éditeur du jeu, a sorti ses premiers jeux Nes sans l'autorisation de Nintendo. Et quand la Super Nes est sortie, le constructeur a ajouté un système pour que les jeux qu'il n'a pas certifié (le fameux logo "Official Nintendo Seal") ne puissent pas fonctionner. Et le seul jeu non certifié sorti sur la console a été Super Noah's Ark 3D. L'autre chose insolite à propos du jeu est son étrange ressemblance avec Wolfenstein 3D, car id Software a donné le code source du jeu à Wisdom Tree, Inc.. Les rumeurs veulent qu'ils l'auraient fait car la version SNES de Wolfenstein 3D était inférieure à la version PC du jeu à cause de Nintendo qui aurait fait pression pour retirer des choses du jeu, notamment abaisser le niveau de violence.

Le jeu est re-sorti sur Steam au mois de juin 2015 et tourne nativement sur les systèmes d'exploitation modernes et supporte les hautes résolutions. La version Steam inclut également la version SNES.

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